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miRNA-Seqサービス

High Speed Sequencing/Next Generation Sequencing

miRNA Seq Analysis Service


基本的プロセシング

入力:FASTQもしくはFASTA形式ファイル(.fastq, .fq. fa)、あるいはcolorspace;1つのライブラリに1つのファイル。お客様のご要望に基づき、データはMySQL形式、CSVもしくはエクセル ファイルで提出します。基本料金には2つのライブラリのプロセシングを含みます。各ライブラリは最大1千万リード、もしくは500Mbです。

Basic Processing

We accept input using FASTQ files, FASTA files plus quality information or raw files from Illumina GA, Life Technologies ABI SOLiD and Roche 454.


作業項目

詳細

Description

Deliverables

リファレンスゲノムとライブラリへのマッピング

  1. マップしたシーケンスのリスト
  2. シーケンス分類(miRNA, tRNA, rRNAなど)
  3. それぞれのサンプルにおける分類・非分類分子全ての 発現レベルの定量化

Mapping to reference genome and libraries

  1. List of mapped sequences
  2. Sequence classification (miRNA, tRNA, rRNA)
  3. Quantification of expression levels of all classified and unclassified molecules in each sample

発現プロファイリング

先端的な方法による正規化と発現量解析

Expression profiling

Advanced normalization and differential expression analysis


更なるサービス

ご要望に応えて、様々な追加サービスがご利用できます。 例:

  • Webサイトの強化
  • Simbiotを使用したデータ提出とプロセシング

Additional Processing

Beyond basic processing we offer comprehensive data management, development of web-based repositories.
Please contact Japan Bioinformatics KK for more information.